北京妇产医院和北京妇幼保健院没有区别，是一家医院。从临床来说，首都医科大学附属北京妇产医院、北京妇幼保健院是集医疗、教学、科研、预防、保健为一体，以诊治妇产科常见病、多发病和疑难病症为重点的国内知名的三级甲等妇产专科医院。

另外，2002年6月由北京市政府投资兴建的集北京市妇女保健所、北京市儿童保健所、北京市计划生育技术研究指导所、北京妇产医院功能为一体的北京妇幼保健院，在朝阳区团结湖院区落成，医院随之更名为首都医科大学附属北京妇产医院北京妇幼保健院。